#창궁의 파프너 인류가 지구 외의 지적 생명체와 처음으로 조우하는데 성공한 2113년. 그러나 이 퍼스트 컨텍트는 그리 낙관적이지 못했다. 인간의 생각을 읽어내는 엄청난 힘을 가진 수수께끼의 적에 의해 인류는 괴멸적인 타격을 받게 된다. 일방적으로 이어지는 공세에 더 이상 반격할 힘도 남아 있지 않은 지구. 그러나 2116년 마침내 일본 열도가 지구상에서 완전히 소멸하는 사고와 함께 전쟁은 일시 소강 상태로 접어든다. 그리고 시간이 흘러 평화로운 타츠미야섬에서 이야기는 시작된다. 마카베 카즈키는 어렸을때부터 친구 사이였으나 어느새 소원해진 미나시로…